据报道，对检方积极侦办自己，却对绿营天王的案子毫无动静，马英九难掩不满。他表示，检方说会用一致的标准处理特别费，他的案子与绿营四大天王被检举的时间差不到一个月，“全台湾都看到，就是马英九一个人在被调查、传讯啊，其它人都没有动啊！”

　　马英九说，民进党“立委”指控他的罪名是公款入私帐，让他觉得莫名其妙，这些钱是当局依“法”汇给他的，而申报财产也是“法律”规定“政府首长”应尽的义务，“如果这也是贪污，这还有天理吗？”

　　马英九强调，他主观认知，如果检方要以侵占公款做为起诉他的理由，前提必须是当时他知道这是一笔公款，而且他有侵占的故意，才能构成犯罪。

　　马英九并说， 全台湾有好几万“首长”都用过特别费，他不相信有人在领到这笔钱时，会认为这是公款，因为公款的特色是必须用借支的方式，而在借支的过程中也必须记账，若没有用完，还必须结报，可是他在领到这笔钱时，已经核销了。他去问主计单位，答案是这笔钱已经核销出去，就没有剩余的问题，如果要去追问钱怎么用，就出现了“二次核销”的问题，但在会计上没有二次核销的问题，因为钱已经给了“首长”了。

　　而马英九也强调，如果他有侵占意图，就不会用汇款的方式领取，而是用现款，然后说他花光了，他所有汇款统统留下纪录，“如果我真的想犯法，怎么会把犯罪的证据留得这么完整，让检方去查呢？”

　　马英九喊冤，如果检察官认为这部分特别费没有用完，必须要退还，也应该告知他相关规定，“但从来没有人告诉过我，那主计部门不是失职吗？要因为这样办我，这不是违反信赖保护原则？”他强调，退一万步讲，即使真的要还，也没有贪污的问题，“只有民事上，没有刑事上的问题，因为我没有犯罪的故意嘛”。

　　他认为，检方可能会先入为主地认为这笔钱是公款，但实际上，而“法务部”在去年的法律咨询意见，就认为这笔钱是实质津贴，而且是行之多年、相沿成习，甚至可以成为行政惯例或习惯法，“如果这样会构成五年以上的重罪，那谁还敢用啊？”马英九无奈的说，“我老老实实的做公务员，怎么会一觉醒来，就变成贪污重犯？”“自己不敢说是乐善好施，但愿意跟人分享我的财产与健康，我不是一个贪得无厌的小人。”