传染性非典型肺炎确诊后在医院治疗期间逃跑，这样造成传染源扩散，传染病防治法里面有规定，中华人民共和国领域里面一切单位和个人，必须对医疗保健机构卫生防疫机构所采取的查询、检验调查取证和预防控制必须服从，必须接受。

法律规定一定要进行隔离治疗，如果已经隔离或者擅自逃跑由我们公安机关协助医疗单位进行强制隔离，法律规定这个隔离是有一定的强制性，在一定程度上限制了当事人的人身自由，法律这样规定是必要的。第一有效禁止这个病。第二有利于防止这个病向他的亲属、家属、邻居以及社会扩散，保护公众利益，法律这样规定，病人应该理解协助。